内容简介
随着分子生物学的发展,肿瘤的发生、发展机制正在逐步被阐明,分子靶向药物已成为抗肿瘤新药的主力军,但不是所有的肿瘤患者都能从靶向药物的治疗中获得疗效。肿瘤组织的基因突变直接决定靶向药物的疗效,所以对肿瘤组织中的基因突变进行检测是使用靶向药物的前提。与传统化疗药物不同,靶向药物的耐药更快,如何动态跟踪耐药突变的产生及其丰度变化是精准给药的重要内容。
与基因多态性检测不同,基因突变检测的难点在于“大海捞针”,即如何从正常基因组织已有的背景中检出少量的突变。为此发展了诸多基因突变检测方法,这些方法大都由两部分组成:一是对靶标序列的扩增,二是对扩增产物中的待测位点的识别。根据不同的扩增方法以及不同的序列识别方法产生了原理不同的基因突变检测方法,如ARMS-PCR法、焦磷酸测序法、实时Invader法等,这些方法在分析灵敏度和特异性上以及在样品测定通量和测定成本上都具有较大差别,《基因突变检测技术与精准给药》对常用及新发展的基因突变方法在方法原理、测定流程、注意事项和检测实例等方面进行了详细阐述。
同时,《基因突变检测技术与精准给药》还融入了作者课题组多年来个体化用药相关基因标志物检测技术的研究成果和临床检测经验。
除此之外,《基因突变检测技术与精准给药》还介绍了用于精准给药的液态活检技术,即用于单细胞测定的高通量测序技术和用于血液中低丰度基因突变检测的数字化扩增技术。这些前沿技术也是精准医学的重要工具,可以实时动态监测患者服用药物后的耐药基因突变情况。
随着精准医学研究计划的深入,新的给药理念正在改变传统的合理给药模式,使基于患者遗传信息的个体化给药上升为基于靶点动态特征的精准给药。为提高药学临床服务的质量,精准给药必须渗透到临床一线,但精准给药需要基因突变检测技术支撑,如何选择合适的检测方法呢?我们想通过《基因突变检测技术与精准给药》,为广大临床药学工作者详细解答各类检测技术的特点和适用性,使读者在全面了解检测方法的基础上选择合适的检测方法。
内页插图
目录
第一章 PAP技术
第一节 技术方法
一、基本原理
二、双向PAP等位基因特异性扩增技术
三、多重剂量PAP技术
四、连接反应介导的PAP技术
五、基于PAP法的重测序技术
第二节 应用实例
一、MAP技术检测外周循环血中肿瘤突变标志物以监测非转移性乳腺癌复发
二、PAP结合荧光定量PCR技术(RT-PAP)检测体细胞突变
第三节 展望
第二章 ARMS技术
第一节 基于电泳检测的ARMS技术
第二节 基于荧光探针检测的ARMS技术
第三章 高通量测序技术
第一节 Roche454测序技术
第二节 IlluminaSolexa测序技术
第三节 AppliedBiosystemsSOLiD测序技术
第四节 HelicosBiosciencestSMS(TM)测序技术
第五节 PacificBiosciencesSMRT测序技术
第六节 OxfordNanopore纳米孔单分子测序技术
第四章 数字化PCR技术
第一节 微球一微乳相数字化PCR技术平台
第二节 微阵列式数字化PCR技术平台
第三节 微液滴式数字化PCR技术平台
第五章 基于纳米金探针的可视化检测
第一节 耦联模板扩增反应的纳米金探针检测技术
第二节 耦联信号扩增反应的纳米金探针检测技术
第三节 基于纳米金的试纸条技术
第四节 基于纳米金探针的生物条形码技术
第五节 基于纳米金的其他检测技术
第六章 基于核酸侵入反应的基因突变检测技术
第一节 级联核酸侵入技术
第二节 核酸侵入反应耦联切刻内切酶信号扩增法
第三节 核酸侵入反应耦联纳米金探针可视化检测法
第四节 核酸侵入反应耦联延伸链置换信号扩增法
第七章 焦磷酸测序技术
第一节 焦磷酸测序技术原理
第二节 焦磷酸测序检测仪器
一、商品化焦磷酸测序仪
二、自制单通道小型焦磷酸测序仪
三、自制8通道焦磷酸测序仪
第三节 焦磷酸测序技术在基因突变检测中的应用
一、肿瘤分子靶向个体化治疗
二、病毒检测及耐药性鉴定
三、遗传疾病诊断
四、细菌耐药基因突变检测
第四节 展望
第八章 液相芯片技术
第一节 概述
一、引言
二、技术特点
第二节 原理及应用
一、方法原理
二、应用实例
三、展望
第九章 微阵列芯片技术
第一节 微阵列芯片技术概述
一、概念
二、特点
三、分类
四、制作技术
五、基本操作原理
第二节 铺瓦式阵列技术
第三节 直接等位基因特异性荧光检测技术
第四节 辅助寡核酸链检测技术
第五节 基于连接酶检测反应技术
第六节 基于肽核酸检测技术
第七节 微阵列芯片技术展望
一、药物基因组学与合理用药
二、微阵列芯片技术在合理用药中的应用前景
三、微阵列芯片技术检测微生物存在的问题
四、展望
第十章 COLDPCR技术
第一节 Full-COLDPCR技术和Fast-COLDPCR技术
第二节 Ice-COLDPCR技术
第三节 Temperature-TolerantCOLDPCR技术
第十一章 限制性片段长度多态性聚合酶链反应技术
第一节 RFLP-PCR技术
第二节 错配RFLP-PCR技术
第三节 巢式RFLP-PCR技术
第十二章 杂交链式反应技术
第一节 基本的HCR反应原理
第二节 HCR调控的荧光银纳米簇检测法
第三节 基于嵌二萘探针的HCR检测方法
第四节 耦联G四联体的HCR检测方法
第十三章 蓝白斑筛选技术
第一节 方法原理
第二节 应用实例
一、抗肌萎缩蛋白基因突变检测
二、肿瘤相关EGFR基因突变检测
第三节 展望
第十四章 液体活检技术
第一节 循环肿瘤DNA的检测
一、循环肿瘤DNA的来源与意义
二、循环肿瘤DNA的提取与富集
三、循环肿瘤DNA检测技术
四、循环肿瘤DNA在临床诊断检测中的应用
第二节循环肿瘤细胞的检测
一、循环肿瘤细胞的来源与意义
二、循环肿瘤细胞的富集与鉴定
三、循环肿瘤细胞检测技术
四、循环肿瘤细胞在肿瘤检测中的应用
第三节 外泌体的检测
一、外泌体的来源与意义
二、外泌体的提取与富集
三、外泌体检测技术
四、外泌体在临床诊断检测中的应用
前言/序言
随着分子生物学的发展,肿瘤的发生、发展机制正在逐步被阐明,分子靶向药物已成为抗肿瘤新药的主力军,但不是所有的肿瘤患者都能从靶向药物的治疗中获得疗效。肿瘤组织的基因突变直接决定靶向药物的疗效,所以对肿瘤组织中的基因突变进行检测是使用靶向药物的前提。与传统化疗药物不同,靶向药物的耐药更快,如何动态跟踪耐药突变的产生及其丰度变化是精准给药的重要内容。
与基因多态性检测不同,基因突变检测的难点在于“大海捞针”,即如何从正常基因组织已有的背景中检出少量的突变。为此发展了诸多基因突变检测方法,这些方法大都由两部分组成:一是对靶标序列的扩增,二是对扩增产物中的待测位点的识别。根据不同的扩增方法以及不同的序列识别方法产生了原理不同的基因突变检测方法,如ARMS-PCR法、焦磷酸测序法、实时Invader法等,这些方法在分析灵敏度和特异性上以及在样品测定通量和测定成本上都具有较大差别,本书对常用及新发展的基因突变方法在方法原理、测定流程、注意事项和检测实例等方面进行了详细阐述。同时,本书还融入了作者课题组多年来个体化用药相关基因标志物检测技术的研究成果和临床检测经验。除此之外,本书还介绍了用于精准给药的液态活检技术,即用于单细胞测定的高通量测序技术和用于血液中低丰度基因突变检测的数字化扩增技术。这些前沿技术也是精准医学的重要工具,可以实时动态监测患者服用药物后的耐药基因突变情况。
随着精准医学研究计划的深入,新的给药理念正在改变传统的合理给药模式,使基于患者遗传信息的个体化给药上升为基于靶点动态特征的精准给药。为提高药学临床服务的质量,精准给药必须渗透到临床一线,但精准给药需要基因突变检测技术支撑,如何选择合适的检测方法呢?我们想通过本书,为广大临床药学工作者详细解答各类检测技术的特点和适用性,使读者在全面了解检测方法的基础上选择合适的检测方法。
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