内容简介
《生命科学实验指南系列 RNA纳米技术与治疗:方法与方案》主要内容是对近年来与RNA纳米技术以及它在纳米生物技术和纳米医药的应用直接相关的技术和实验室方案的汇编。涉及的主题包括分析RNA结构和性能的各种生物化学、生物物理和生物信息学方法;分析RNA结构的多级装配过程的方法:通过超速离心和高效液相色谱法(HPLC)纯化多功能RNA纳米颗粒;体内RNA纳米构建物的实时检测;成像、目标定位和治疗效应模块分子结合到RNA支架上;RNA-蛋白质纳米结构的设计和特性描述等。
RNA纳米技术是一个涉及材料工程和合成结构生物学的新领域,是一种新兴的生物化学和纳米材料的交叉学科。
《生命科学实验指南系列 RNA纳米技术与治疗:方法与方案》各章节涵盖的研究方法可供RNA/DNA相关科学研究的研究生和博士后研究人员逐步地进行理解和操作。
《生命科学实验指南系列 RNA纳米技术与治疗:方法与方案》亦可作为关注RNA纳米技术的从事物理、工程和生命科学研究的人员的学习参考材料。
内页插图
目录
前言
第1章 RNA纳米技术方法综述-RNA纳米颗粒的合成、纯化及特性
1 RNA纳米技术的定义
2 构建多功能RNA纳米颗粒
2.1 纳米颗粒的RNA支架组装
2.2 合并功能模块为RNA纳米颗粒
3 多功能RNA纳米颗粒的纯化和特征
3.1 凝胶移位分析
3.2 超速离心法
3.3 高效液相色谱法
3.4 RNA纳米颗粒的结构特征
3.5 RNA纳米颗粒的功能试验
4 展望
5 结论
致谢
参考文献
第2章 调查细菌小调控RNA自我组装的多种方法
1 引言
2 材料
2.1 试剂
2.2 缓冲液和溶液
3 方法
3.1 用于聚合作用研究的小非编码RNA(sRNA)的体外转录
3.2 电泳分析sRNA的自组装
3.3 二级结构预测和sRNA自组装最小序列的特征
3.4 热变性分析
3.5 利用近红外光谱分析碱基配对
3.6 sRNA组装的分子成像
3.7 粗提物中sRNA聚合物的检测
3.8 非编码sRNA的RT-PCR定量分析
3.9 结论
4 注释
致谢
参考文献
第3章 使用AFM测量包含核糖核苷酸的DNA分子的弹性
1 引言
2 材料
2.1 寡核苷酸
2.2 寡核苷酸上硫醇基的去保护
2.3 原子力显微镜底衬的制备
2.4 制备镀金的羧基修饰的氮化硅悬臂
2.5 在金表面固定DNA底衬
2.6 原子力显微镜液体电池
2.7 原子力显微镜和配件
3 方法
3.1 制备含核糖核苷一磷酸的DNA寡核苷酸
3.2 制备双链嵌入式.核糖核苷一磷酸DNA基质
3.3 制备镀金羧基修饰氮化硅悬臂及含核糖核苷一磷酸的DNA基质的固定化
3.4 用于测量力的原子力显微镜的校准
3.5 原子力显微镜液体电池的清洁
3.6 利用原子力显微镜力光谱测量双链含核糖核苷一磷酸的DNA的弹性
3.7 数据分析
4 注释
致谢
参考文献
第4章 RNA纳米技术之银纳米簇:RNA纳米颗粒组装的观察
以及跟踪的步骤
1 引言
2 材料
2.1 转录和RNA纳米颗粒组装成分
2.2 Ag:RNA成分
3 方法
3.1 RNA合成
……
第5章 利用制备性超速离心大规模纯化RNA纳米颗粒
第6章 HPLC纯化长达59个核苷酸具有单核苷酸分辨率的RNA适配体
第7章 在原核和真核细胞中利用具有热力学稳定基序和荧光模块的RNA纳米颗粒实时检测RNA的折叠和翻转
第8章 小RNA3'端氧化的荧光标记
第9章 RNA纳米颗粒对转移性肿瘤靶向定位及给药的方法和分析
第10章 RNA纳米颗粒在脑瘤中靶向给药的功能性试验
第11章 适配体介导的纳米颗粒相互作用:从寡核苷酸,蛋白质复合体到SELEX筛选
第12章 通过黏性桥组合特异性的适配体-siRNA纳米颗粒的方法内化B细胞淋巴瘤
第13章 一种用于在人黑色素瘤细胞中剪接转换寡核苷酸的功能运输的高通量筛选方法
第14章 RNA-蛋白纳米结构的设计、组装和评估
第15章 利用CLIP-Seq技术在病毒中定位RNA和蛋白质的相互作用
第16章 用RCAP、RNA交联和肽段指纹识别技术定位蛋白质-RNA相互作用
参考文献
前言/序言
此书是大家所熟知的“Methods in Molecular Biology”实验室方案系列丛书的新成员。尽管已出版了一本特刊“Methods”(Volume 54;Issue 2,Page 201-294,2011,Elsevier)和一部著作(RNA Nanotechnology and Therapeutics,2013,CRC出版社),这本书仍是对与RNA纳米技术及其在纳米生物技术和纳米医药中的应用直接相关的技术和实验室方案的首次汇编。RNA纳米技术(Guo P.Nature Nanotechnology,2010,5:833-842)利用在多层次结构水平的RNA折叠和装配的模块化及设计性来合理设计并功能化具有不同应用的RNA纳米颗粒。虽然在15年前自下而上组装RNA纳米技术的概念就被证明过(Guoeta1.Molecular Cell,1998.2:149),但在这个领域中有意义的进步也只是近5年的事情。为了推进该领域研究迈向新的高度,我们及时编辑出版了这本方法书,供从事物理、工程和生命科学的研究人员参考。
本书涵盖的研究方法很广泛,便于经历过不同科学训练的研究生和博士后人员分步进行理解与操作。全书内容包括:分析核糖核酸(RNA)结构和性能的各种生物化学、生物物理和生物信息学方法(第2~4章);分析RNA结构的多级装配过程的方法(第4、7和10章);通过超速离心和高效液相色谱法(HPLC)(第5和6章)纯化多功能RNA纳米颗粒;体内RNA纳米构建物的实时检测(第7、9、10章);成像、目标定位和治疗模块结合到RNA支架上(第8~13章);RNA-蛋白质纳米结构的设计和特性描述(第14~16章)。这项任务的完成得益于在这一领域领先的有关专家,花费大量时间编写了各章节,在此,我们向他们表示衷心感谢。同时,由衷感谢Humana出版社/Springer的编辑和制作人员,尤其要感谢的是Methods in Molecular Biology系列丛书的总编辑John Walker先生,是他让我们下决心着手实施这个计划。我们很高兴这本内容丰富的书得以出版,希望各领域的研究者均能从中有所收益。
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