普通高等教育“十一五”国家级规划教材：基因组学（第3版） 下载 mobi epub pdf 电子书 2024

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内容简介

　　基因组学是当代生命科学发展迅速、关注度较高的学科之一。《普通高等教育“十一五”国家级规划教材：基因组学（第3版）》是国内一本专门并全面介绍基因组学及其研究进展的学术著作，自2002年第1版、2007年第2版出版发行以来，在专业领域产生较大影响。本次修订突出系统性和简明实用性，重点阐述了基因组学的基本概念、基本理论，介绍了研究基因组的基本思路与技术手段，充分吸收了近几年国内外学科重要进展。
　　全书共分14章，分别是：基因组、遗传图绘制、物理图绘制、基因组测序与序列组装、基因组序列注释、基因组解剖、基因的转录调控、转录物组、蛋白质组、基因组表观遗传、基因组的复制、基因组进化的分子基础、基因组进化的模式、基因组与生物进化。
　　与第2版相比，第3版在如下方面做出了重大调整：第4章新增第三代测序；第5章增加基因本体及采用Gene Ontology注释基因方法；第8章由原“RNA修饰与加工”改为“转录物组”，第8章中涉及小RNA、非编码RNA及其在不同层次的基因调控内容进行更新；第9章由原来的“蛋白质合成与加工”改为“蛋白质组”，相关内容进行更新；第10章扩充了表观遗传学内容。书后新增索引，各个章节根据学科进展和教学需要，对有关数据、图表、思考题、参考文献等也进行了更新和调整。
　　《普通高等教育“十一五”国家级规划教材：基因组学（第3版）》可供综合性大学、高等师范院校、农林院校及医学院校本科生使用，也可供研究生及有关科研人员参考。

内页插图

目录

第1章 基因组
1.1 遗传的分子基础
1.1.1 DNA的化学与生物学
1.1.2 RNA的化学与生物学
1.1.3 蛋白质的结构与生物学
1.2 基因组序列复杂性
1.2.1 C值与C值悖理
1.2.2 序列复杂性
1.2.3 基因组的序列组成
1.3 基因与基因家族
1.3.1 编码RNA的基因
1.3.2 编码蛋白质的基因
1.3.3 基因家族
1.3.4 异常结构基因
1.3.5 假基因
1.4 染色体
1.4.1 真核生物染色体
1.4.2 原核生物染色体
1.5 基因组
1.5.1 人类基因组
1.5.2 其他生物基因组

第2章 遗传图绘制
2.1 遗传图与物理图
2.2 遗传作图标记
2.2.1 基因标记
2.2.2 DNA标记
2.3 遗传作图的方法
2.3.1 孟德尔遗传学简介
2.3.2 连锁分析
2.3.3 不同模式生物的连锁分析
2.4 遗传图绘制
2.4.1 人类遗传图
2.4.2 水稻遗传图

第3章 物理图绘制
3.1 限制性作图
3.1.1 限制性作图的基本方法
3.1.2 限制性作图的局限
3.2 基于克隆的基因组作图
3.2.1 大分子DNA的克隆载体
3.2.2 重叠群组建
3.2.3 指纹作图
3.3 原位染色体连锁图
3.3.1 同位素或荧光标记探针的原位杂交
3.3.2 原位杂交
3.4 辐射杂种作图
3.4.1 序列标签位点
3.4.2 辐射杂种作图的程序与方法
3.5 基因组整合图
3.5.1 人类基因组整合图
3.5.2 水稻基因组整合图

第4章 基因组测序与序列组装
4.1 PDNA测序的方法
4.1.1 第一代DNA测序
4.1.2 第二代DNA测序
4.1.3 第三代DNA测序
4.2 基因组测序
4.2.1 基因组测序的策略
4.2.2 基因组测序的覆盖面
4.2.3 序列间隙与物理间隙
4.2.4 插入片段的两端测序
4.3 序列组装
4.3.1 作图法测序与序列组装
4.3.2 鸟枪法测序与序列组装
4.3.3 不同测序路线与序列组装策略的比较
4.4 基因组测序的其他路线
4.4.1 重要区域的优先测序
4.4.2 EST测序
4.4.3 环境共栖生物基因组测序
4.5 人类基因组测序与组装
4.5.1 人类基因组的测序策略
4.5.2 人类基因组测序的伦理学问题
4.5.3 人类基因组测序计划相关的重大事件

第5章 基因组序列注释
5.1 搜寻基因
5.1.1 根据基因结构特征搜寻基因
5.1.2 同源基因查询
5.1.3 实验确认基因
5.1.4 基因的命名与分类
5.2 基因注释
5.2.1 计算机预测基因功能
5.2.2 蛋白质结构域在功能预测中的意义
5.2.3 根据协同进化注释基因功能
5.3 基因功能检测
5.3.1 基因失活是基因功能分析的主要手段
5.3.2 基因的过量表达用于基因功能检测
5.4 高通量基因功能的研究方法
5.4.1 突变库构建
5.4.2 RNA干扰与基因功能检测
5.4.3 蛋白质互作
5.5 功能基因组学
5.5.1 组学简介
5.5.2 转录物组
5.5.3 蛋白质组
5.5.4 基因本体

第6章 基因组解剖
6.1 原核生物基因组解剖
6.1.1 原核生物基因组的物理结构
6.1.2 原核生物基因组的遗传组成
6.2 真核生物基因组解剖
6.2.1 真核生物核基因组
6.2.2 真核生物细胞器基因组
6.3 转座因子与分散重复序列
6.3.1 DNA转座子
6.3.2 逆转录因子与分散重复序列家族
6.3.3 真核生物分散重复序列的比较
6.4 串联重复序列及其分布
6.5 人类基因组的结构与组成
6.5.1 人类基因组编码基因
6.5.2 人类基因组非编码基因
6.6 拟南芥基因组的结构与组成
6.6.1 蛋白质编码基因
6.6.2 RNA编码基因

第7章 基因的转录调控
7.1 原核生物基因的转录
7.1.1 转录起始调控
7.1.2 转录延伸与终止调控
7.2 真核生物基因的转录
7.2.1 RNA聚合酶与转录因子
7.2.2 真核生物PolΙ基因的转录起始与终止
7.2.3 真核生物PolⅡ基因的转录起始与终止
7.2.4 真核生物PolⅢ基因的转录起始与终止
7.2.5 细胞器基因的转录
7.3 古细菌基因的表达调控
7.4 基因的转录调控
7.4.1 转录调控的顺式元件
7.4.2 转录调控的反式因子
7.4.3 转录因子与调控序列的互作
7.4.4 转录因子家族

第8章 转录物组
第9章 蛋白质组
第10章 基因组表观遗传
第11章 基因组的复制
第12章 基因组进化的分子基础
第13章 基因组进化的模式
第14章 基因组与生物进化
索引

前言/序言

　　由于DNA测序技术的革新与发展，目前国内外基因组测序计划已经覆盖到几乎所有具有重要经济价值和理论研究意义的物种。同时，由于DNA测序技术的改进提高了DNA测序的效率，极大地降低了测序成本，促使了转录物组研究的蓬勃与深入发展，获取了许多此前无法探知的基因组表达谱信息。此外，生物信息技术的开发与应用，加快与深化了对结构基因组和功能基因组海量数据的分析、整理与归纳，使研究者得以从生命的整体视角，从生物体的不同结构层次和活性水平了解与认识基因组结构与功能、保守与进化的生物学意义。
　　《基因组学》第2版出版至今已经过去了5个年头。5年时间在科学研究的历史长河中只是一个瞬间，但对基因组学领域的研究而言，过去的5年取得了许多值得关注的进展。为了尽可能地反映基因组学领域的研究现状，为读者学习基因组学提供一些有益的参考，第3版沿袭原有的结构框架，在第2版的基础上，对原有的一些内容做了修改或重新撰写。在第4章中添加了第三代DNA测序，第5章中增加了基因本体以及采用Gene Ontology注释基因的方法。第8章的题目由原来的“RNA的修饰与加工”改为“转录物组”，第9章的题目由原来的“蛋白质的合成与加工”改为“蛋白质组”，相关内容进行更新。此外，近年来在基因组小RNA和非编码RNA研究领域取得了许多突破性进展，为在不同层次的调控水平解读基因功能提供了新的思路，为此在第8章中专门补充了许多相关的内容。
　　修订过程中也对各章节的参考文献进行了一次全面的梳理，尽可能地列出了相关领域的最新文献。限于篇幅，仍然有许多基因组学研究领域的重要进展未能在新版中体现，读者如有兴趣可以查阅相关的参考文献。
　　本书的再版编写工作得到了复旦大学生命科学院各方面的支持与帮助。作者实验室的王莹同学和刘爽同学在本书的文字校对、文献查阅以及编写内容安排等方面做了大量工作，并提出了一些好的建议，在此表示衷心感谢。
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