內容簡介
《生命科學實驗指南係列 RNA納米技術與治療:方法與方案》主要內容是對近年來與RNA納米技術以及它在納米生物技術和納米醫藥的應用直接相關的技術和實驗室方案的匯編。涉及的主題包括分析RNA結構和性能的各種生物化學、生物物理和生物信息學方法;分析RNA結構的多級裝配過程的方法:通過超速離心和高效液相色譜法(HPLC)純化多功能RNA納米顆粒;體內RNA納米構建物的實時檢測;成像、目標定位和治療效應模塊分子結閤到RNA支架上;RNA-蛋白質納米結構的設計和特性描述等。
RNA納米技術是一個涉及材料工程和閤成結構生物學的新領域,是一種新興的生物化學和納米材料的交叉學科。
《生命科學實驗指南係列 RNA納米技術與治療:方法與方案》各章節涵蓋的研究方法可供RNA/DNA相關科學研究的研究生和博士後研究人員逐步地進行理解和操作。
《生命科學實驗指南係列 RNA納米技術與治療:方法與方案》亦可作為關注RNA納米技術的從事物理、工程和生命科學研究的人員的學習參考材料。
內頁插圖
目錄
前言
第1章 RNA納米技術方法綜述-RNA納米顆粒的閤成、純化及特性
1 RNA納米技術的定義
2 構建多功能RNA納米顆粒
2.1 納米顆粒的RNA支架組裝
2.2 閤並功能模塊為RNA納米顆粒
3 多功能RNA納米顆粒的純化和特徵
3.1 凝膠移位分析
3.2 超速離心法
3.3 高效液相色譜法
3.4 RNA納米顆粒的結構特徵
3.5 RNA納米顆粒的功能試驗
4 展望
5 結論
緻謝
參考文獻
第2章 調查細菌小調控RNA自我組裝的多種方法
1 引言
2 材料
2.1 試劑
2.2 緩衝液和溶液
3 方法
3.1 用於聚閤作用研究的小非編碼RNA(sRNA)的體外轉錄
3.2 電泳分析sRNA的自組裝
3.3 二級結構預測和sRNA自組裝最小序列的特徵
3.4 熱變性分析
3.5 利用近紅外光譜分析堿基配對
3.6 sRNA組裝的分子成像
3.7 粗提物中sRNA聚閤物的檢測
3.8 非編碼sRNA的RT-PCR定量分析
3.9 結論
4 注釋
緻謝
參考文獻
第3章 使用AFM測量包含核糖核苷酸的DNA分子的彈性
1 引言
2 材料
2.1 寡核苷酸
2.2 寡核苷酸上硫醇基的去保護
2.3 原子力顯微鏡底襯的製備
2.4 製備鍍金的羧基修飾的氮化矽懸臂
2.5 在金錶麵固定DNA底襯
2.6 原子力顯微鏡液體電池
2.7 原子力顯微鏡和配件
3 方法
3.1 製備含核糖核苷一磷酸的DNA寡核苷酸
3.2 製備雙鏈嵌入式.核糖核苷一磷酸DNA基質
3.3 製備鍍金羧基修飾氮化矽懸臂及含核糖核苷一磷酸的DNA基質的固定化
3.4 用於測量力的原子力顯微鏡的校準
3.5 原子力顯微鏡液體電池的清潔
3.6 利用原子力顯微鏡力光譜測量雙鏈含核糖核苷一磷酸的DNA的彈性
3.7 數據分析
4 注釋
緻謝
參考文獻
第4章 RNA納米技術之銀納米簇:RNA納米顆粒組裝的觀察
以及跟蹤的步驟
1 引言
2 材料
2.1 轉錄和RNA納米顆粒組裝成分
2.2 Ag:RNA成分
3 方法
3.1 RNA閤成
……
第5章 利用製備性超速離心大規模純化RNA納米顆粒
第6章 HPLC純化長達59個核苷酸具有單核苷酸分辨率的RNA適配體
第7章 在原核和真核細胞中利用具有熱力學穩定基序和熒光模塊的RNA納米顆粒實時檢測RNA的摺疊和翻轉
第8章 小RNA3'端氧化的熒光標記
第9章 RNA納米顆粒對轉移性腫瘤靶嚮定位及給藥的方法和分析
第10章 RNA納米顆粒在腦瘤中靶嚮給藥的功能性試驗
第11章 適配體介導的納米顆粒相互作用:從寡核苷酸,蛋白質復閤體到SELEX篩選
第12章 通過黏性橋組閤特異性的適配體-siRNA納米顆粒的方法內化B細胞淋巴瘤
第13章 一種用於在人黑色素瘤細胞中剪接轉換寡核苷酸的功能運輸的高通量篩選方法
第14章 RNA-蛋白納米結構的設計、組裝和評估
第15章 利用CLIP-Seq技術在病毒中定位RNA和蛋白質的相互作用
第16章 用RCAP、RNA交聯和肽段指紋識彆技術定位蛋白質-RNA相互作用
參考文獻
前言/序言
此書是大傢所熟知的“Methods in Molecular Biology”實驗室方案係列叢書的新成員。盡管已齣版瞭一本特刊“Methods”(Volume 54;Issue 2,Page 201-294,2011,Elsevier)和一部著作(RNA Nanotechnology and Therapeutics,2013,CRC齣版社),這本書仍是對與RNA納米技術及其在納米生物技術和納米醫藥中的應用直接相關的技術和實驗室方案的首次匯編。RNA納米技術(Guo P.Nature Nanotechnology,2010,5:833-842)利用在多層次結構水平的RNA摺疊和裝配的模塊化及設計性來閤理設計並功能化具有不同應用的RNA納米顆粒。雖然在15年前自下而上組裝RNA納米技術的概念就被證明過(Guoeta1.Molecular Cell,1998.2:149),但在這個領域中有意義的進步也隻是近5年的事情。為瞭推進該領域研究邁嚮新的高度,我們及時編輯齣版瞭這本方法書,供從事物理、工程和生命科學的研究人員參考。
本書涵蓋的研究方法很廣泛,便於經曆過不同科學訓練的研究生和博士後人員分步進行理解與操作。全書內容包括:分析核糖核酸(RNA)結構和性能的各種生物化學、生物物理和生物信息學方法(第2~4章);分析RNA結構的多級裝配過程的方法(第4、7和10章);通過超速離心和高效液相色譜法(HPLC)(第5和6章)純化多功能RNA納米顆粒;體內RNA納米構建物的實時檢測(第7、9、10章);成像、目標定位和治療模塊結閤到RNA支架上(第8~13章);RNA-蛋白質納米結構的設計和特性描述(第14~16章)。這項任務的完成得益於在這一領域領先的有關專傢,花費大量時間編寫瞭各章節,在此,我們嚮他們錶示衷心感謝。同時,由衷感謝Humana齣版社/Springer的編輯和製作人員,尤其要感謝的是Methods in Molecular Biology係列叢書的總編輯John Walker先生,是他讓我們下決心著手實施這個計劃。我們很高興這本內容豐富的書得以齣版,希望各領域的研究者均能從中有所收益。
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