常用計算機輔助藥物設計軟件教程 pdf epub mobi txt 電子書下載 2025

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張亮仁編

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齣版社：中國醫藥科技齣版社

ISBN：9787506792158

版次：1

商品編碼：12184560

包裝：平裝

開本：16開

齣版時間：2017-04-01

用紙：膠版紙

頁數：257

字數：257000

正文語種：中文

具體描述

內容簡介

　　計算機輔助藥物設計已成為一門新興的研究領域，在閤理藥物設計中發揮不可或缺的作用。
　　《常用計算機輔助藥物設計軟件教程》依據實際工作中各種軟件的應用，介紹瞭分子動力學模擬、分子對接、蛋白質同源模建、定量構效關係的研究、藥效團的構建、虛擬篩選等內容，且每一內容有不止一個軟件的使用介紹，適閤入門計算機輔助藥物設計的廣大師生參考使用。

內頁插圖

第一章同源模建法預測蛋白質結構
第一節同源模建概述
第二節同源模建

第二章分子對接預測結閤位點
第一節利用AutoDock進行分子對接
第二節利用D0CK進行分子對接
第三節利用Surflex-Dock進行分子對接
第四節利用GOLD進行分子對接

第三章蛋白質與核酸的分子動力學模擬
第一節分子動力學概述
第二節利用GROMACS進行純蛋白分子動力學模擬
第三節蛋白與小分子復閤物的動力學模擬
第四節核酸分子動力學模擬

第四章利用OpenEye組件包進行虛擬篩選
第一節軟件簡介
第二節利用OpenEye組件包進行虛擬篩選

第五章定量構效關係分析
第一節 CoMFA&CoMSIA;
第二節 HQsAR

第六章藥效團
第一節藥效團介紹
第二節利用Discovery Studio進行藥效團模型構建

第七章全新藥物設計
第一節概述
第二節利用LigBuilder進行全新藥物設計

第八章作圖軟件PyMOL的應用
第一節 PyMOL簡介
第二節 PyMOL基本操作

第九章藥物設計實例
第一節利用OpenEye發現F．tularensis烯酰基載體蛋白還原酶FabI抑製劑
第二節基於模建結構的虛擬篩選發現對蝦黃頭病毒蛋白酶抑製劑
第三節基於藥效團建模和分子對接的虛擬篩選發現？-分泌酶抑製劑
參考文獻
彩圖

前言/序言

　　從20世紀90年代開始，隨著計算機技術的迅速發展以及藥物化學、分子生物學和計算化學的發展，計算機輔助藥物設計（CADD）也快速發展起來，成為一門新興的研究領域。與此同時，CADD的發展和應用，也大大促進瞭藥物設計和新藥開發的效率，CADD現在已經成為閤理藥物設計中不可或缺的一環，在藥物設計中起著越來越重要的作用。因此，CADD方法的理論和應用研究具有非常重要的意義。關於CADD的理論，很多教科書和專著已進行大量介紹，適閤初學者學習理論知識，但是在實際中的操作，卻鮮有基礎書目可以參考。本書編者長期從事相關工作，根據在實際工作中對各種軟件的應用，編寫瞭本書，介紹計算機輔助藥物設計時需要用到的部分軟件的使用，以實現設計目的為導嚮，著重介紹軟件的操作方法，使用過程中的細節與原理，可以使初學者迅速入門。本書內容包含瞭分子動力學模擬、分子對接、蛋白質同源模建、定量構效關係的研究、藥效團的構建、虛擬篩選等內容，且每一內容有不止一個軟件的使用介紹，希望能對入門計算機輔助藥物設計的廣大師生有所幫助。
　　本書的編寫是從初學者的角度，手把手、一步一步介紹各軟件的使用方法、功能，並配有圖片，使初學者能夠順利學習。使用各種常用軟件。
　　限於編者的水平有限，書中可能存在不妥之處，敬請廣大讀者批評和指正。